L'objectif du jeu est de guider une grenouille vers chacune des maisons vides en haut de l'écran. Le jeu commence avec trois grenouilles. Perdre toutes les grenouilles est terminé. Le joueur utilise le joystick à 4 directions pour sauter une fois sur la grenouille. Frogger est soit un joueur solo, soit deux joueurs à tour de rôle.

La grenouille commence au bas de l'écran, qui contient une route horizontale occupée par des véhicules à grande vitesse tels que des voitures de course, des buggys, des camions et des bulldozers. Le joueur doit guider la grenouille entre les voies de circulation opposées pour éviter de devenir un accident de la route et de perdre une vie. Après avoir traversé la route, une bande médiane sépare les deux grandes parties de l'écran. La moitié supérieure est constituée d'une rivière avec des bûches, des alligators et des tortues, tous se déplaçant horizontalement sur l'écran dans des directions opposées. En sautant sur des bûches en mouvement rapide et sur le dos des alligators et des tortues, le joueur peut guider la grenouille vers la sécurité. Le joueur doit éviter les serpents, les loutres et la gueule ouverte des alligators. Une grenouille femelle aux couleurs vives se trouve parfois sur une bûche et peut être transportée contre des points bonus. Tout en haut de l'écran contient cinq "maisons de grenouilles", et au moins une est toujours ouverte et disponible. Ceux-ci contiennent parfois des insectes bonus ou des alligators mortels.

Lorsque les cinq grenouilles sont chez elles, le jeu passe au niveau suivant avec une difficulté accrue. Après cinq niveaux, la difficulté diminue brièvement et augmente à nouveau progressivement après chaque niveau. La minuterie donne 30 secondes pour guider chaque grenouille dans l'une des maisons et se réinitialise à 60 ticks chaque fois qu'une vie est perdue ou qu'une grenouille rentre chez elle en toute sécurité.